ubuntu 卸载软件 命令

sudo apt-get -purge remove 软件名

komodo 安装（各种坑爹状况）

komodo 安装（各种坑爹状况）

komodo

感谢这位大虾破解komodo 点我

安装komodo，linux复制lic文件到主目录的.ActiveState目录下 。

/home/此处输入自己的用户名/.ActiveState

这个目录是隐藏目录 需要加上－a才看得到.并且要打开一次komodo这个目录才会出现

命令行  export PATH=$PATH:/home/此处输入自己的用户名/Komodo-IDE-7/bin/    （ export PATH="/home/此处输入自己的用户名/Komodo-IDE-7/bin:$PATH" 
）

ln -s "/home/xinwen/Komodo-IDE-7/bin/komodo" /usr/local/bin/komodo

如果你在命令行输入komodo能弹出软件才算是安装好。

(export PATH=/usr/bin:/bin)

sed 匹配

sed -n ‘/pattern/w   newfile'  oldfile

匹配 pattern的行，输出newfile

awk '/A/||/B/||/C/{print}' test >newfile

匹配 A或者B或者C的行 输出 newfile

500k-genechip 生成seg文件的genepattern处理程序

1。cel文件压缩为zip文件
2。生成snp（genepattern）
3。合并snp文件，去除head上的nsp和sty
4。制作info文件
5。xcorrect
6。生成cn文件
7。parrellCBS生成seg文件
8。IGV viewer

genepattern debug

1。所有空白处都要改为TAB
2。所有间隔都是TAB
3。每行结尾处都是TAB
4。file结尾处不能有多余的空白行
5。info file跟data的name要保持一致，大小写一致
出错：

如果是nullpointerexloption  是名称没对上

如果是 out～～～可能是file结尾多了空白行
如果是java heap space可能是文件过大，需要切割